Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Aebp1Q640N1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms