Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sema5aQ62217 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms