Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnrpaQ62189 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnrpaQ62189 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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