Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttf1Q62187 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms