Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Itga6Q61739 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Itga6Q61739 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms