Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EsrrbQ61539 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EsrrbQ61539 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms