Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PcolceQ61398 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PcolceQ61398 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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