Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamb3Q61087 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms