Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
DbpQ60925 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms