Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Mkrn3Q60764 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Mkrn3Q60764 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Mkrn3Q60764 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Mkrn3Q60764 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Mkrn3Q60764 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Mkrn3Q60764 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Mkrn3Q60764 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Mkrn3Q60764 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Mkrn3Q60764 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Mkrn3Q60764 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mkrn3Q60764 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Mkrn3Q60764 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Mkrn3Q60764 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mkrn3Q60764 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Mkrn3Q60764 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Mkrn3Q60764 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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