Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ItgaeQ60677 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms