Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trim38Q5SZ99 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trim38Q5SZ99 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim38Q5SZ99 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms