Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Myh1Q5SX40 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms