Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Vmn1r195Q5SVD6 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r195Q5SVD6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms