Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms