Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Utp18Q5SSI6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Utp18Q5SSI6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms