Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sun3Q5SS91 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms