Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Trdv2-2Q5R1A4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms