Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trappc1Q5NCF2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Trappc1Q5NCF2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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