Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt35Q497I4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms