Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ulk4Q3V129 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ulk4Q3V129 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms