Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ppp4r3cQ3V0Y1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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