Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Gm26649-201ENSMUST00000181595 3196 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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SvipQ3UZP4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
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SvipQ3UZP4 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
SvipQ3UZP4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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