Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mbd3l2Q3UXB0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms