Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nr1d1Q3UV55 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nr1d1Q3UV55 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms