Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms