Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Hdgfl2Q3UMU9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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Hdgfl2Q3UMU9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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