Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Gtpbp6Q3U6U5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms