Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Palb2Q3U0P1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Palb2Q3U0P1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms