Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc9Q3U0M1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc9Q3U0M1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms