Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hhla1Q3TYV2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hhla1Q3TYV2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms