Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3TTJ4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms