Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc10Q3TLI0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms