Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cul4aQ3TCH7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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