Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Treml4Q3LRV9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms