Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zbtb38Q3LR78 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms