Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim71Q1PSW8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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