Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ptcd3Q14C51 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ptcd3Q14C51 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms