Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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ptchd1Q14B62 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
ptchd1Q14B62 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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ptchd1Q14B62 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
ptchd1Q14B62 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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