Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39dQ0VF76 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39dQ0VF76 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39dQ0VF76 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39dQ0VF76 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc39dQ0VF76 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttc39dQ0VF76 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms