Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpne7Q0VE82 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpne7Q0VE82 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms