Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Vps8Q0P5W1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Vps8Q0P5W1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms