Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnnm1Q0GA42 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cnnm1Q0GA42 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms