Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Plac8l1Q08EJ0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms