Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssrp1Q08943 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssrp1Q08943 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms