Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gata4Q08369 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms