Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cnn1Q08091 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cnn1Q08091 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cnn1Q08091 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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