Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Col17a1Q07563 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms