Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn3Q07409 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn3Q07409 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms