Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Elobl-201ENSMUST00000061938 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Siah2Q06986 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Siah2Q06986 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms